Séquençage haut débit et écologie microbienne

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Chimie / Bio

Process et métiers des laboratoires

Intra-entreprise

Présentiel

Distanciel

Français

Objectifs

Comprendre le séquençage génomique à haut débit.
Être capable de choisir la technologie adaptée à son projet.
Connaître les outils bio-informatiques utilisés.
Connaître les analyses statistiques possibles.

Prérequis

Bases de biologie moléculaire et PCR

Moyens pédagogiques et d’encadrement

Plateforme digitale de formation dédiée (LMS)
Séances avec le formateur, Support pédagogiques format numérique, alternance entre théorique et pratique, cas concrets

Dispositif de suivi et d’évaluation des acquis

Mise en pratique et exercices, Appréciation de la formation à chaud.

Résultats & compétences attendus à l’issue de la formation :

À l’issue de cette formation, le participant sera en mesure de déterminer comprendre le séquençage génomique à haut débit, de solliciter les technologies et outils bio-informatiques appropriés et d’effectuer les analyses statistiques potentielles.

Programme de la formation

Méthodes moléculaires
- Séquençage HTS.
- Métagénomique ciblée.
- Métagénomique globale.
- Analyses RNA-seq.
- CRISPR/Cas9.
Applications en écologie microbienne
- Extraction d’ADN microbien.
- Analyse bioinformatique des séquences.
- L’analyse de données :
  - Diversité, cluster, réseau, core-microbiome

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Durée

7 heures

Niveau

Débutant

Public

Scientifiques souhaitant acquérir les concepts théoriques et les applications du séquençage haut débit en écologie microbienne.

Participants

8 personnes maximum

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